כשלים בצמד תרמי הם אחד הגורמים העיקריים להשבתת מערכת הרץ החמה, ולבעיות נפוצות יש מאפיינים וגורמים ברורים. הכשל השכיח ביותר הוא מעגל פתוח, בעיקר עקב שבירה פנימית של חוט סגסוגת הנגרמת מעייפות תרמית ברכיבה, רעידות מכניות או התקנה וכיפוף לא נאותים. שינויי טמפרטורה תכופים גורמים להתרחבות והתכווצות חוזרים ונשנים של החוט, מה שמוביל בסופו של דבר לשבר, במיוחד עבור צמדים תרמיים באיכות נמוכה-.
קצר חשמלי היא בעיה נפוצה נוספת, הנגרמת בדרך כלל עקב נזק לשכבת הבידוד הפנימית. חדירת פלסטיק מותך, שחיקת לחות או קורוזיה כימית יפגעו בבידוד תחמוצת המגנזיום, ויגרמו לשני חוטי הסגסוגת למגע וליצור הפרעות אות. סחף טמפרטורה נפוצה גם היא, הנובעת מחומרי סגסוגת לא טהורים, התיישנות-בטמפרטורה גבוהה או שימוש-לטווח ארוך, מה שמוביל למדידת טמפרטורה לא מדויקת ומשפיעה על איכות הדפוס.
נזק מכני, כגון בדיקות מרוסקות, כבלים בלויים או מחברים רופפים, יגרום להפסקת אות לסירוגין ולטמפרטורה לא יציבה. בנוסף, הפרעות אלקטרומגנטיות מחוטים לא מסוככים או חיווט בלתי סביר יעוותו את האות של הצמד התרמי, וכתוצאה מכך תנודות טמפרטורה. ניתן למנוע בעיות רבות על ידי בחירה במוצרים- באיכות גבוהה, תקינה של התקנה ותחזוקה שוטפת. הבנת הבעיות הנפוצות הללו עוזרת למשתמשים לאבחן במהירות תקלות ולהפחית את הפסדי הייצור.
