בהתבסס על ההתמקדות הקודמת בכיול של מערכות ניטור טמפרטורת רצים חמים והצורך ב-כוונן מחדש לאחר כיול נקודה מלאה-, שלבי ההפעלה הסטנדרטיים לכוונון PID עצמי- הם כדלקמן:
הכנה: הגדר את הטמפרטורה של כל אזורי החימום ברץ החם לערכי ייצור רגילים. כבה את מי הקירור של התבנית כדי להבטיח שהרץ החם נמצא במצב יציב, לא עמוס, תוך הימנעות מהפרעות חיצוניות.
מפעיל עצמי-מנהור: אתר את לחצן הכוונון העצמי של "AT"- בלוח הבקרה של בקר הטמפרטורה. לחץ והחזק למשך 3-5 שניות כדי להפעיל את ההתחלה. הפאנל יציג מחוון ריצה לכוונון עצמי.
ממתין לפעולה אוטומטית: המערכת תבצע אוטומטית 2-3 מחזורי חימום-שלמים של קירור יתר, בהתאמה אוטומטית למאפייני אינרצית החימום של הרץ החם. כל התהליך לוקח בערך 15-30 דקות. אין לנתק את החשמל או להפסיק את הפעולה בזמן זה.
אימות והשלמה: לאחר השלמת הכוונון העצמי-, המערכת שומרת אוטומטית את פרמטרי ה-PID החדשים. התבונן במשך 30 דקות כדי לאשר שאין חריגה משמעותית בטמפרטורה ושתנודות- במצב יציב נשלטות בטווח של מעלה ±1. זה משלים את כל הפעולה. סט שלבים זה תואם לרוב מערכות בקרת הטמפרטורה של הרץ החם התעשייתי, בעל סף הפעלה נמוך וניתן להשלים אותו בקלות על ידי מתחילים.

