הצטברות-לטווח ארוך של שאריות פירוק נמסות מוגזות בתוך סעפות וחרירים חמים יוצרת שכבת זיהום מוליכה קשה על מפגשי חישה של צמד תרמי, הגורמת לסחיפה נסתרת של טמפרטורה, פלט אות לא יציב וקורוזיה פנימית מואצת של בדיקה, תקלה כרונית שכיחה שרוב המפעלים מגלים רק לאחר חלקים פגומים המונית. שאריות פירוק נמס נוצרות כאשר חומרים פלסטיים נשארים באזורי-מעל טמפרטורה למשך זמן רב מדי; פולימרי ABS, PC, PA ו-PPS מתפרקים תחת חום מוגזם ליצירת חלקיקי פחמן שחור, מעורבבים עם תוספים מעכבי בעירה ושברי סיבי זכוכית ליצירת משקעי פחמן דביקים הנצמדים בחוזקה למשטחי מתכת.
קצות בדיקה קפיציות של צמד תרמי בשערי הזרבובית מתמודדים עם זיהום שאריות הפחמן החמור ביותר. התכה בטמפרטורה- גבוהה זורמת דרך השער בכל מחזור הזרקה, נושאת חלקיקי פחמן מרחפים כדי לפגוע במשטח ראש החישה. לאחר מאות מחזורי ייצור, שכבת פחמן צפופה בעובי 0.03-0.1 מ"מ מכסה את פני המגע השטוחים של בדיקה הקפיצית. לפחמן יש ביצועי בידוד תרמי חלשים אך מוליכות חשמלית חזקה, היוצרת שתי שכבות של נזק בו זמנית. ראשית, סרט הפחמן חוסם את העברת החום בין מתכת הזרבובית לצומת החישה, ומייצר טמפרטורה המוצגת נמוכה ב-10-30 מעלות מטמפרטורת ההיתוך בפועל; הבקר מגביר ללא הרף את כוח המחמם, מחמיר את התחממות היתר המקומית ומאיץ פחמיזציה נוספת של החומר, ויוצר מעגל קסמים. שנית, שאריות פחמן מוליכות מחברות בין מעטפת הצמד התרמי לבין חוט החישה הפנימי, מה שגורם לסירוגין להתראות של הארקה קצרה במעגל במהלך התרחבות תרמית.
צמדים תרמיים משובצים בסעפת עמוקה-צוברים שאריות פחמן בתוך חור המדידה הסגור. גז נדיף נמס הנושא חלקיקי פחמן מתעבה במרווח הצר בין מעטפת הגשושית לדופן החור, ויוצר משקעי פחמן עבים שלא ניתן לפוצץ אותם על ידי אוויר דחוס רגיל. הפחמן המצטבר ממלא את המרווח השמור להתפשטות תרמית, סוחט את הנדן המשוריין ושורד את שכבת ההגנה החיצונית, ומאפשר לאדי פלסטיק קורוזיביים לחדור אל פנים הגשושית ולחמצן את צומת הסגסוגת החמה. בדיקות אטומות ללא תפרים יכולות להאט את חדירת שאריות, אך זיהום פחמן פני השטח עדיין גורם לקיזוז מדידה מתמשך שלא ניתן לכייל על ידי תוכנת הבקר.
קושי הניקוי משתנה מאוד בהתאם למבנה הצמד התרמי. ניתן לפרק את דגמי הזרבובית הקפיציים החשופים ולנגב אותם בעזרת אלכוהול בטמפרטורה- גבוהה ורפידות ליטוש מתכת עדינות כדי להסיר שאריות פחמן, אך בדיקות עמוקות- המוטבעות היטב דורשות פירוק מלא של סעפת לניקוי יסודי, שגוזלים 4-6 שעות של השבתה בייצור. לצמדים תרמיים עם כפתורים שטוחים אולטרה- לתבניות מיקרו יש משטחי חישה זעירים שבהם מצטברות שאריות פחמן בבורות מיקרו, מה שמצריך ניקוי קולי כדי להסיר לחלוטין. חומרי שחרור של עובש סיליקון המעורבבים עם שאריות פחמן יוצרים סרט מורכב במיוחד-שלא ניתן להסירו על ידי אלכוהול בלבד, זקוק לממיסים מיוחדים לניקוי פחמן של עובש שיש לנגב אותם במלואם לפני ההתקנה מחדש כדי למנוע זיהום משני.
אמצעי מניעה סטנדרטיים מפחיתים את זיהום שאריות הפחמן של צמתים תרמיים באופן יסודי. ראשית, שמור על משוב טמפרטורה מדויק של צמד תרמי כדי למנוע נקודות חמות נסתרות הגורמות לפירוק נמס; כיול חודשי קבוע מונע התחממות יתר לטווח ארוך- המופעל על ידי סחיפה של אותות. שנית, בצע הליכי טיהור עובש כל 8-משמרת עם חומרי ניקוי ייעודיים-בטמפרטורה גבוהה כדי לשטוף חלקיקי פחמן מרחפים בתוך תעלות הרץ. שלישית, פירוק וניקוי שבועי של בדיקות קפיצי זרבובית נגישות להסרת משקעי פחמן לפני היווצרות שכבות עבות. רביעית, בצע אופטימיזציה של פרמטרי מחזור ההזרקה כדי להפחית את זמן השהייה בפלסטיק בתוך ערוצי רץ חמים, תוך חיתוך המקור לייצור שאריות פחמן. שליטה בזמן של זיהום שאריות פירוק נמס מייצבת את דיוק המדידה של הצמד התרמי, מפחיתה את תדירות ניקוי העובש ומונעת חלקי פלסטיק פגומים באצוות הנגרמים על ידי סחף של טמפרטורה הנגרמת על ידי פחמן.
