טיהור עובש חיוני לניקוי שאריות פלסטיק מוגז בתוך תעלות זרימה חמות, אך בחירת חומרי טיהור לא נכונה, הגדרת הטמפרטורה ושלבי הפעולה ישרטו, יחלידו או יזהמו בדיקות של צמד תרמי, יאיץ את הסחף האותות ויקצר את חיי השירות באופן דרסטי. מפעילים רבים מתמקדים רק בהשפעת הניקוי של הרץ ומתעלמים מהגנה על חיישני טמפרטורה במהלך הטיהור, מה שיוצר תקלות נסתרות של צמד תרמי שצצות לאחר מספר תנועות ייצור.
מקור הנזק החמור ביותר הוא תרכובות לטיהור-מילוי שוחקים. חלק מהמפעלים משתמשים בחומרי ניקוי מלאים בסיבי זכוכית כדי להסיר משקעי פחמן עבים; התכה של טיהור שוחקים בזרימה- גבוהה שוטפת את ראש החישה של הצמד התרמי החשוף בשערי הזרבובית, ויוצרת שריטות ליניאריות עמוקות על פני המעטפת בתוך מחזור טיהור אחד. הקיר החיצוני השרוט מאבד ביצועים נגד-קורוזיה והעברת חום, ויוצר אזורי קיר מקומיים דקים- שנשחקים בקלות במהלך הייצור הרשמי שלאחר מכן. צמדים תרמיים מיניאטוריים עם כפתורים שטוחים במיוחד עבור תבניות מיקרו סובלים משחיקה בלתי הפיכה של פני השטח לאחר פעולת טיהור שוחקים אחת, הדורשת החלפה ישירה. חומרים לטיהור שרף טהור לא-שוחקים ללא מילוי מינרלים או זכוכית הם אמצעי הניקוי היחיד המותר עבור תבניות המצוידות בצמדים תרמיים מדויקים.
טמפרטורת טיהור גבוהה מדי מהווה את גורם הנזק העיקרי השני. לעתים קרובות מפעילים מעלים את טמפרטורת הסעפת והזרבובית ב-30-50 מעלות מעל פרמטרי הייצור הרגילים כדי להאיץ את המסת הפחמן במהלך הטיהור. טמפרטורה גבוהה במיוחד-לטווח ארוך מעל 400 מעלות מעצימה את קנה המידה של החמצון התרמי על משטחי נדן של צמד תרמי, ויוצרות שכבות תחמוצת בידוד שחורות עבות הגורמות לקיזוז טמפרטורה קבוע. עבור גשושי קסטנטן מסוג J-, טיהור מעל- טמפרטורה מפעיל חמצון מהיר של צומת, יוצר סחף אפס חמור שלא ניתן לכייל לאחר מכן. מפרטי טיהור סטנדרטיים מגבילים את טמפרטורת החימום ללא יותר מ-20 מעלות מעל הגדרות הייצור הרגילות, עם זמן החזקה מתמשך של-טמפרטורות גבוהות נשלט תוך 15 דקות.
שלבי פעולת טיהור שגויים גורמים לזיהום מכני ולנזק התנגשות. טכנאים רבים מגבירים את לחץ ומהירות ההזרקה כדי לחזק את אפקט הניקוי; נמס טיהור זורם ב-לחץ גבוה-מהיר-נושא חלקיקי פחמן מוצקים כדי לפגוע בראשי הצמד התרמי של הזרבובית העמוסים בקפיץ-, פוגע במשטח המגע השטוח ומחליש את גמישות הקפיץ הפנימית. לאחר הטיהור, שאריות של חומר טיהור מעורבב עם שאריות פחמן מתמצקות על חיבורי חישת בדיקה, ויוצרות שכבות זיהום מרוכבות קשות החוסמות את העברת החום. ניפוח ישיר של אקדח אוויר ללא פירוק בדיקה מניע אבק פחמן עדין לתוך חורי מדידה עמוקים רבים, מצטבר סביב מעטפות צמד תרמיות משובצות ויוצר מחסומי התנגדות תרמית מתמשכים.
חומרי ניקוי כימיים קורוזיביים מביאים לסיכוני קורוזיה נסתרים. ממיסים לניקוי פחמן עובש חומצה חזקה המותזים בתוך סעפות חודרים למרווחים זעירים של מעטפות תרמיים במהלך השרייה, חורטים חריצים על משטחי נירוסטה ומחמצנים צמתים פנימיים של סגסוגת. אם הממס הכימי אינו מטוהר לחלוטין ומייבש לפני חימום מחדש של העובש, אדי חומצה נדיפים מאיצים קורוזיה ארוכת טווח של בדיקה במהלך מחזורי ייצור. כאשר ניקוי כימי אינו נמנע, יש לפרק את כל הגשושיות של הצמד התרמי ולאטום בקופסאות אחסון יבשות מראש.
נהלי טיהור מגן סטנדרטיים מבטלים נזק לצמד תרמי באופן יסודי: אימוץ שרף טיהור שאינו-שוחק, בקרת טמפרטורת הטיהור וזמן ההחזקה בקפדנות, הפחתת לחץ ומהירות ההזרקה כראוי, פירוק בדיקות קפיצי זרבובית חשופות לפני ניקוי כימי, ונשוף לגמרי חורי מדידה סעפת עם חנקן יבש לאחר כל מחזור טיהור. הסדרת פעולות טיהור העובש בהתאם לתקני הגנה מונעת שחיקה מיותרת של צמד תרמי, חמצון וזיהום, מאריכה את חיי השירות ביותר מחצי ומפחיתה את חוסר היציבות של טמפרטורת הטיהור לאחר-הפגמים.
